Optimisation combinatoire Combinatorial Optimisation Imbalanced Data Données asymétriques Supervised Classification Classification supervisée Partial Classification Classification partielle EXplainable AI (XAI) IA explicable Medical Informatics Informatique médicale
Avant ma thèse j'ai réalisé un prototype pour le projet ANR AKENATON, qui visait à la classification automatique d'alertes issues de pacemakers, en tenant compte du contexte du patient, à l'aide d'un système expert de 35 règles et d'ontologies. Sur le projet RNTL Faros, j'ai travaillé pour l'équipe GOAL (Groupe sur les Objets et composAnts Logiciels) sur un démonstrateur cible du procédé, à base de programmation par contrats et aspects, appliqué au Dossier Médical Personnel (DMP).
Durant ma thèse dans l'équipe DOLPHIN (Discrete multi-objective Optimization for Large scale Problems with Hybrid dIstributed techNiques) j'ai proposé l'algorithme MOCA-I, un algorithme de classification supervisé adapté aux particularités des données médicales : asymétrie, incertitude et volumétrie en colonnes. Cet algorithme d'optimisation obtient statistiquement de meilleurs modèles que les algorithmes état de l'art. J'ai également élaboré le prototype d'Opcyclin, un logiciel de recrutement pour les essais cliniques dans lequel s'intègre MOCA-I.
Après ma thèse, j'ai continué à travailler en entreprise pendant 4 ans. J'ai été la responsable scientifique en entreprise d'une thèse CIFRE (2014-2017 Optimisation combinatoire et extraction de connaissances sur données hétérogènes et temporelles : application à l’identification de parcours patients) pour la prise en compte de la temporalité dans MOCA-I et l'élaboration d'une méthode de bi-clustering adaptée aux particularités des données médicales. J'ai également orchestré la mise en place de l'évaluation médicale de MOCA-I pour la détection de patients, sur les essais cliniques (Opcyclin) et pour la détection de patients porteurs de bactéries multi-résistantes.
Depuis décembre 2017, je suis enseignant chercheur à la faculté de gestion, économie et sciences de l'Institut Catholique de Lille. Depuis 2019, je suis chercheur associé à CRIStAL équipe ORKAD. Je co-encadre deux thèses : Meyssa Zouambi - "Configuration Automatique de réseaux de neurones profonds, à l'aide de méthodes multi-objectif" (co-encadrement 50%, Clarisse Dhaenens 50%) et Mounir Hafsa - Planification et Recommendations pour les formations professionnelles (thèse CIFRE Mandarine Academy, co-encadrement 50%, Laetitia Jourdan 50%). Je travaille également avec Hélène Touzet (équipe Bonsai) sur les données de spectres MALDI FT-ICR issus de prélèvements archéologiques.
Depuis janvier 2018 j'enseigne à la faculté de gestion, économie et sciences de l'Institut Catholique de Lille, de la 1ère année de licence au master 2 pour un total de 980h ETD (dont 418h C et 442h TD). J'enseigne ou j'ai enseigné sur des matières variées : architecture des ordinateurs, bases de données (base & avancé), sciences des données, intelligence artificielle (apprentissage automatique), programmation python, programmation micro:bit, design patterns, méthodes agiles, ergonomie et connaissance de l'entreprise.
Entre 2012 et 2016 j'ai enseigné en tant qu'enseignant vacataire à l'Université de Lille I, en plus de mon activité professionnelle. J'ai enseigné les bases de données (base & avancé), le PHP/MySQL, l'informatique décisionnelle, la fouille de données, la programmation avancée et c/système à l'UFR IEEA de l'Université de Lille 1 (M1 MIAGE), Polytech'Lille (GIS2 et IMA) et IUT (Licence Pro) pour un total de 84 heures de cours, 72h TD et 186h TP (320h ETD).
M. Vandromme, J. Jacques, J. Taillard, L. Jourdan and C. Dhaenens
IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering - vol. 34, no. 2, pp. 506-518, 1 Feb. 2022, doi: 10.1109/TKDE.2020.2983692
Julie Jacques, Helene Martin-Huyghe, Justine Lemtiri-Florek, Julien Taillard, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens, David Delerue, Arnaud Hansske, Valerie Leclercq
International Journal of Medical Informatics,2020,104242,ISSN 1386-5056, October 2020, Volume 142, https://doi.org/10.1016/j.ijmedinf.2020.104242
C. Dhaenens, J. Jacques, V. Vandewalle, M. Vandromme, E. Chazard, C. Preda, A. Amarioarei, M. Chaiwuttisak, C. Cozma, G. Ficheur, M-E. Kessaci, R. Perichon, J. Taillard, R. Bordet, A. Lansiaux, L. Jourdan, D. Delerue A. Hansske
IRBM - Innovation and Research in BioMedical Engineering, Elsevier, Volume 39, Issue 2, April 2018, Pages 83-92, 2018
M. Vandromme, J. Jacques, J. Taillard, L. Jourdan, C. Dhaenens
Knowledge Based System, accepted (2017)
Julie Jacques, Julien Taillard, David Delerue, Clarisse Dhaenens,Laetitia Jourdan
Applied Soft Computing 34, 705-720, 2015
Arnaud Rosier, Philippe Mabo, Lynda Temal, Pascal Van Hille, Olivier Dameron, Louise Deléger, Cyril Grouin, Pierre Zweigenbaum, Julie Jacques, Laure Laporte, Emmanuel Chazard, Christine Henry, Anita Burgun
Europace, 2015
Burgun A, Rosier A, Temal L, Jacques J, Messai R, Duchemin L, Deléger L, Grouin C, Van Hille P, Zweigenbaum P, Beuscart R, Delerue D, Dameron O, Mabo P, Henry C.
IRBM Ingénierie et Recherche Biomédicale, Volume 32, Issue 3, June 2011, Pages 191–194
Magnaghi, E., Flambard, V., Mancini, D., Jacques, J. & Gouvy, N.
Lecture Notes in Information Systems and Organisation, 2021, https://doi.org/10.1007/978-3-030-60607-7
Flambard, V., Gouvy, N., Jacques, J., Magnaghi, E., & Mancini, D.
Organizing Smart Buildings and Cities (pp. 1-12). Springer, (2021) 10.1007/978-3-030-60607-7_1
Julie Hamon, Julie Jacques, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens
Handbook of Computational Intelligence 2015; 1211-1223
M. Hafsa, P. Wattebled, J. Jacques and L. Jourdan
2021 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC), 2021, pp. 997-1004, doi: 10.1109/CEC45853.2021.9504797
Sara Tari, Lucien Mousin, Julie Jacques, Marie-Eléonore Kessaci, Laetitia Jourdan
LION 2020, 151-157. Doi : 10.1007/978-3-030-53552-0_16
Sara Tari, Holger H. Hoos, Julie Jacques, Marie-Eleonore Kessaci and Laetitia Jourdan
PPSN 2020 (Parallel Problem Solving From Nature) https://dx.doi.org/10.1007/978-3-030-58112-1_5
Sara Tari, Nicolas Szczepanski, Lucien Mousin, Julie Jacques, Marie-Eleonore Kessaci and Laetitia Jourdan
IEEE Congress on Evolutionary Computation 2020 https://dx.doi.org/10.1109/CEC48606.2020.9185785
Maxence Vandromme,Julie Jacques,Julien Taillard, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens
Metaheuristics International Conference, MIC 2017 (accepted)
Maxence Vandromme, Julie Jacques, Julien Taillard, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens
Second International Workshop on Machine Learning, Optimization and Big Data - MOD 2016, LNCS 10122, 2016
Vandromme Maxence,Julie Jacques,Taillard Julien, Jourdan Laetitia, Dhaenens Clarisse
etaheuristics International Conference, MIC 2015
Julie Jacques, Julien Taillard, David Delerue, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens
Proceeding of the fifteenth annual conference on Genetic and evolutionary computation conference, pp 543-550.
Julie Jacques, Julien Taillard, David Delerue, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens
Learning and Intelligent OptimizatioN Conference, LION 7, Lecture Notes in Computer Science 2013, pp 37-51
Pascal Van Hille,Julie Jacques,Julien Taillard, Arnaud Rosier, David Delerue, Anita Burgun,Olivier Dameron
MIE 2012 - Studies in Health Technology and Informatics. 180:300-304,2012
Julie Jacques, Hélène Martin-Huyghe, Justine Lemtiri-Florek, Julien Taillard, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens, David Delerue, Arnaud Hansske and Valérie Leclercq
International Conference on Learning and Intelligent Optimization, LION 2020, Oral Communication
Julie Jacques, Julien Taillard, David Delerue, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens
META 2012: International Conference on Metaheuristics and Nature Inspired Computing, October 27th-31th 2012, Port El-Kantaoui, Tunisia
Hasfa Mounir, Pamela Wattebled, Julie Jacques, Laetitia Jourdan
Congrès annuel de la société Française de Recherche Opérationnelle et d’Aide à la Décision ROADEF 2021, Apr 2021, Mulhouse, France.
Sara Tari, Laetitia Jourdan, Marie-Eléonore Kessaci, Julie Jacques, Lucien Mousin
Congrès annuel de la société Française de Recherche Opérationnelle et d’Aide à la Décision (ROADEF), Feb 2020, Montpellier, France
Julie Jacques, David Delerue, Laetitia Jourdan, Clarisse Dhaenens
ROADEF 2011: 12e congrès annuel de la Société française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision, Saint-Étienne : France (2011)
Radja Messai, Julie Jacques, Régis Beuscart
Extraction et Gestion de Connaissance 2011, Atelier Extraction de Connaissance et Santé
Total d'environ 1300h ETD (442h C + 482h TD + 218h TP/Tutorat)